Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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FarsaQ8C0C7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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FarsaQ8C0C7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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FarsaQ8C0C7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
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FarsaQ8C0C7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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FarsaQ8C0C7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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FarsaQ8C0C7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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FarsaQ8C0C7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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FarsaQ8C0C7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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