Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ctdsp2Q8BX07 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ctdsp2Q8BX07 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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