Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWW9

Pkn2, Serine/threonine-protein kinase N2, mousemouse

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Length 983 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn2Q8BWW9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn2Q8BWW9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn2Q8BWW9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms