Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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