Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcal1Q8BJL0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms