Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Frmd4aQ8BIE6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frmd4aQ8BIE6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frmd4aQ8BIE6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frmd4aQ8BIE6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frmd4aQ8BIE6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Frmd4aQ8BIE6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frmd4aQ8BIE6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frmd4aQ8BIE6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frmd4aQ8BIE6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frmd4aQ8BIE6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Frmd4aQ8BIE6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms