Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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