Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubash3bQ8BGG7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms