Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htatsf1Q8BGC0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms