Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms