Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfascQ810U3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms