Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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