Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AknaQ80VW7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AknaQ80VW7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AknaQ80VW7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AknaQ80VW7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AknaQ80VW7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AknaQ80VW7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AknaQ80VW7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AknaQ80VW7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms