Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2eQ80UW8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms