Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rims3Q80U57 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms