Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna12Q80SS5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms