Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

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Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Dsg1bQ7TSF1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Dsg1bQ7TSF1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Dsg1bQ7TSF1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1bQ7TSF1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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