Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Sbno2Q7TNB8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbno2Q7TNB8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms