Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynmQ70IV5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms