Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnih3Q6ZWS4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms