Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gja6Q6S5G4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms