Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rad54bQ6PFE3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rad54bQ6PFE3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rad54bQ6PFE3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rad54bQ6PFE3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rad54bQ6PFE3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rad54bQ6PFE3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rad54bQ6PFE3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rad54bQ6PFE3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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