Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms