Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Casc4Q6P2L7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Casc4Q6P2L7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Casc4Q6P2L7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Casc4Q6P2L7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Casc4Q6P2L7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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