Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CltbQ6IRU5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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