Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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Pdzrn3Q69ZS0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Pdzrn3Q69ZS0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Pdzrn3Q69ZS0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Pdzrn3Q69ZS0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Pdzrn3Q69ZS0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Pdzrn3Q69ZS0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
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Pdzrn3Q69ZS0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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