Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ino80dQ66JY2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ino80dQ66JY2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms