Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top2bQ64511 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms