Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Zfp248Q640N4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Zfp248Q640N4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Zfp248Q640N4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Zfp248Q640N4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Zfp248Q640N4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Zfp248Q640N4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Zfp248Q640N4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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