Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
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