Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms