Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms