Protein–RNA interactions for Protein: Q62170

Selplg, P-selectin glycoprotein ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelplgQ62170 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SelplgQ62170 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms