Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd47Q61735 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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