Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

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Length 824 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ift88Q61371 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ift88Q61371 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ift88Q61371 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ift88Q61371 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ift88Q61371 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift88Q61371 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ift88Q61371 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ift88Q61371 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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