Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms