Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

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Length 977 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epha1Q60750 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Epha1Q60750 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Epha1Q60750 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epha1Q60750 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epha1Q60750 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epha1Q60750 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epha1Q60750 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epha1Q60750 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epha1Q60750 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epha1Q60750 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epha1Q60750 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epha1Q60750 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms