Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp13a3Q5XF89 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp13a3Q5XF89 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms