Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms