Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim41Q5NCC3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim41Q5NCC3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim41Q5NCC3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms