Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms