Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd53Q3V0J4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ankrd53Q3V0J4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ankrd53Q3V0J4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ankrd53Q3V0J4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ankrd53Q3V0J4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd53Q3V0J4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ankrd53Q3V0J4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms