Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms