Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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