Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Znf48Q3US17 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Znf48Q3US17 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Znf48Q3US17 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Znf48Q3US17 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Znf48Q3US17 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Znf48Q3US17 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Znf48Q3US17 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Znf48Q3US17 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Znf48Q3US17 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Znf48Q3US17 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Znf48Q3US17 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Znf48Q3US17 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Znf48Q3US17 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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