Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS2

Zscan4f, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4fQ3URS2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan4fQ3URS2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms