Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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D13Ertd608eQ3UPR8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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D13Ertd608eQ3UPR8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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