Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrc4Q3UP24 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrc4Q3UP24 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms