Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms