Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
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Usp19Q3UJD6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Usp19Q3UJD6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Usp19Q3UJD6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Usp19Q3UJD6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Usp19Q3UJD6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Usp19Q3UJD6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Usp19Q3UJD6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Usp19Q3UJD6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Usp19Q3UJD6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Usp19Q3UJD6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Usp19Q3UJD6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp19Q3UJD6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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